Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL1P22362 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL1P22362 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL1P22362 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL1P22362 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL1P22362 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL1P22362 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL1P22362 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL1P22362 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL1P22362 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL1P22362 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL1P22362 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL1P22362 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL1P22362 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL1P22362 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL1P22362 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL1P22362 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL1P22362 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL1P22362 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL1P22362 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL1P22362 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL1P22362 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL1P22362 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL1P22362 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL1P22362 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL1P22362 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL1P22362 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL1P22362 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL1P22362 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL1P22362 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL1P22362 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL1P22362 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL1P22362 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL1P22362 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL1P22362 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL1P22362 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL1P22362 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL1P22362 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL1P22362 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL1P22362 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL1P22362 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL1P22362 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL1P22362 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL1P22362 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL1P22362 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL1P22362 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL1P22362 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL1P22362 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL1P22362 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL1P22362 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL1P22362 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL1P22362 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL1P22362 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL1P22362 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL1P22362 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL1P22362 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL1P22362 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL1P22362 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL1P22362 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL1P22362 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL1P22362 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL1P22362 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL1P22362 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL1P22362 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL1P22362 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL1P22362 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL1P22362 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL1P22362 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL1P22362 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL1P22362 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL1P22362 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL1P22362 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL1P22362 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL1P22362 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL1P22362 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL1P22362 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL1P22362 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL1P22362 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL1P22362 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL1P22362 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL1P22362 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL1P22362 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL1P22362 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL1P22362 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL1P22362 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL1P22362 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL1P22362 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL1P22362 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL1P22362 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL1P22362 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL1P22362 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL1P22362 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL1P22362 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL1P22362 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms