Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTNP21246 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTNP21246 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTNP21246 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTNP21246 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTNP21246 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTNP21246 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTNP21246 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTNP21246 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTNP21246 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTNP21246 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTNP21246 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTNP21246 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTNP21246 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTNP21246 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTNP21246 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTNP21246 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTNP21246 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTNP21246 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTNP21246 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTNP21246 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTNP21246 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTNP21246 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTNP21246 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTNP21246 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTNP21246 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTNP21246 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTNP21246 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTNP21246 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTNP21246 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTNP21246 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTNP21246 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTNP21246 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTNP21246 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTNP21246 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTNP21246 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTNP21246 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTNP21246 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTNP21246 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTNP21246 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTNP21246 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTNP21246 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTNP21246 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTNP21246 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTNP21246 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTNP21246 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTNP21246 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTNP21246 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTNP21246 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTNP21246 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTNP21246 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTNP21246 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTNP21246 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTNP21246 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTNP21246 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTNP21246 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTNP21246 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTNP21246 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTNP21246 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTNP21246 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTNP21246 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTNP21246 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTNP21246 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTNP21246 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTNP21246 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTNP21246 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTNP21246 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTNP21246 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTNP21246 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTNP21246 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTNP21246 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTNP21246 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTNP21246 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTNP21246 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTNP21246 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTNP21246 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTNP21246 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTNP21246 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTNP21246 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTNP21246 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms