Protein–RNA interactions for Protein: P16402

HIST1H1D, Histone H1.3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1DP16402 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIST1H1DP16402 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H1DP16402 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST1H1DP16402 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST1H1DP16402 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H1DP16402 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms