Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETFAP13804 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETFAP13804 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETFAP13804 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETFAP13804 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETFAP13804 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETFAP13804 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ETFAP13804 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETFAP13804 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETFAP13804 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETFAP13804 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETFAP13804 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETFAP13804 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETFAP13804 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFAP13804 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFAP13804 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFAP13804 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFAP13804 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFAP13804 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFAP13804 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFAP13804 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFAP13804 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFAP13804 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFAP13804 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFAP13804 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFAP13804 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFAP13804 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFAP13804 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFAP13804 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFAP13804 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFAP13804 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFAP13804 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFAP13804 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFAP13804 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFAP13804 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFAP13804 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFAP13804 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ETFAP13804 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFAP13804 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFAP13804 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFAP13804 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFAP13804 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFAP13804 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFAP13804 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFAP13804 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFAP13804 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFAP13804 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFAP13804 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFAP13804 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFAP13804 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFAP13804 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFAP13804 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFAP13804 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFAP13804 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFAP13804 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFAP13804 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFAP13804 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFAP13804 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFAP13804 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETFAP13804 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETFAP13804 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ETFAP13804 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETFAP13804 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETFAP13804 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETFAP13804 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETFAP13804 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETFAP13804 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETFAP13804 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETFAP13804 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETFAP13804 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETFAP13804 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETFAP13804 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETFAP13804 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ETFAP13804 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETFAP13804 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETFAP13804 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETFAP13804 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETFAP13804 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETFAP13804 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETFAP13804 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETFAP13804 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETFAP13804 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETFAP13804 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETFAP13804 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETFAP13804 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETFAP13804 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms