Protein–RNA interactions for Protein: P0CG01

GKN3P, Gastrokine-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN3PP0CG01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN3PP0CG01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN3PP0CG01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN3PP0CG01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GKN3PP0CG01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKN3PP0CG01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GKN3PP0CG01 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms