Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFB1P0C5Y9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFB1P0C5Y9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2AFB1P0C5Y9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFB1P0C5Y9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFB1P0C5Y9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2AFB1P0C5Y9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2AFB1P0C5Y9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms