Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPIND1P05546 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPIND1P05546 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPIND1P05546 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms