Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLEC3BP05452 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLEC3BP05452 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLEC3BP05452 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLEC3BP05452 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLEC3BP05452 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC3BP05452 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLEC3BP05452 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLEC3BP05452 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLEC3BP05452 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms