Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-AP01891 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-AP01891 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-AP01891 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms