Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-7P01780 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-7P01780 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms