Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA2P01563 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA2P01563 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNA2P01563 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA2P01563 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA2P01563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms