Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDRT1O95170 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT1O95170 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT1O95170 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDRT1O95170 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms