Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN3O75935 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN3O75935 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCTN3O75935 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCTN3O75935 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCTN3O75935 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCTN3O75935 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms