Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP12O75317 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP12O75317 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP12O75317 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP12O75317 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP12O75317 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP12O75317 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP12O75317 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP12O75317 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP12O75317 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP12O75317 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP12O75317 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP12O75317 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP12O75317 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP12O75317 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP12O75317 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP12O75317 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP12O75317 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP12O75317 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP12O75317 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP12O75317 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP12O75317 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP12O75317 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP12O75317 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP12O75317 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP12O75317 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP12O75317 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP12O75317 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP12O75317 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP12O75317 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP12O75317 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP12O75317 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP12O75317 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP12O75317 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP12O75317 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP12O75317 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP12O75317 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP12O75317 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP12O75317 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP12O75317 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP12O75317 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP12O75317 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP12O75317 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP12O75317 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP12O75317 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP12O75317 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP12O75317 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP12O75317 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP12O75317 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP12O75317 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP12O75317 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP12O75317 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP12O75317 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP12O75317 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP12O75317 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP12O75317 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP12O75317 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP12O75317 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP12O75317 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP12O75317 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP12O75317 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP12O75317 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP12O75317 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP12O75317 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP12O75317 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP12O75317 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP12O75317 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP12O75317 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP12O75317 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP12O75317 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP12O75317 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP12O75317 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP12O75317 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP12O75317 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP12O75317 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP12O75317 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP12O75317 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP12O75317 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP12O75317 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP12O75317 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP12O75317 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP12O75317 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP12O75317 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP12O75317 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP12O75317 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP12O75317 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP12O75317 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP12O75317 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP12O75317 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP12O75317 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP12O75317 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP12O75317 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP12O75317 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP12O75317 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP12O75317 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP12O75317 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP12O75317 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP12O75317 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP12O75317 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP12O75317 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms