Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1AO60341 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM1AO60341 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM1AO60341 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1AO60341 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM1AO60341 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms