Protein–RNA interactions for Protein: O15393

TMPRSS2, Transmembrane protease serine 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS2O15393 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMPRSS2O15393 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS2O15393 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS2O15393 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms