Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A7O00341 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A7O00341 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A7O00341 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A7O00341 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms