Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM114B3SHH9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM114B3SHH9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM114B3SHH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM114B3SHH9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM114B3SHH9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM114B3SHH9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM114B3SHH9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms