Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM5B3KS81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM5B3KS81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM5B3KS81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM5B3KS81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRM5B3KS81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms