Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX4

SLC22A31, Putative solute carrier family 22 member 31, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A31A6NKX4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A31A6NKX4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A31A6NKX4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A31A6NKX4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A31A6NKX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A31A6NKX4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms