Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GLTPD2A6NH11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLTPD2A6NH11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLTPD2A6NH11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLTPD2A6NH11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLTPD2A6NH11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLTPD2A6NH11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLTPD2A6NH11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLTPD2A6NH11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLTPD2A6NH11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GLTPD2A6NH11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
GLTPD2A6NH11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLTPD2A6NH11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLTPD2A6NH11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GLTPD2A6NH11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms