Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS37CA5D8V6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS37CA5D8V6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VPS37CA5D8V6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VPS37CA5D8V6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS37CA5D8V6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS37CA5D8V6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS37CA5D8V6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS37CA5D8V6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS37CA5D8V6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS37CA5D8V6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS37CA5D8V6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms