Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CFDP1Q9UEE9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CFDP1Q9UEE9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms