Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNAL1Q9UBT7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms