Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms