Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms