Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms