Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms