Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms