Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms