Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms