Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-224ENST00000589246 594 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 JMJD7-PLA2G4B-203ENST00000476036 577 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-216ENST00000564136 3071 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 MGAT4B-215ENST00000520918 799 ntTSL 313.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 FCHO1-219ENST00000597076 501 ntTSL 413.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CDC27-205ENST00000528147 463 ntTSL 412.86□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-204ENST00000481530 2764 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-214ENST00000563266 568 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 312.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 512.1□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 FCHO1-233ENST00000600393 597 ntTSL 412.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 PPRC1-202ENST00000370012 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 HRC-204ENST00000598858 303 ntTSL 510.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SLC40A1-207ENST00000479598 993 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SLC40A1-203ENST00000427241 824 ntTSL 510.16□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 RTF1-206ENST00000560447 551 ntTSL 39.99□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 PPRC1-205ENST00000489648 744 ntTSL 59.58□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-202ENST00000461666 511 ntTSL 49.46□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-203ENST00000468953 654 ntTSL 49.46□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 PPRC1-206ENST00000495914 564 ntTSL 29.04□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 MGAT4B-204ENST00000518702 542 ntTSL 38.29□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 58.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CD53-203ENST00000471220 657 ntTSL 28.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CNOT2-240ENST00000552599 2360 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 JMJD7-205ENST00000478178 524 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CD53-204ENST00000476408 756 ntTSL 57.05□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 RTF1-203ENST00000473214 475 ntTSL 26.2□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.37□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 RBBP4-219ENST00000531983 473 ntTSL 25.15□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-202ENST00000528805 615 ntTSL 1 (best)5.1□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OTUD3-203ENST00000481686 269 ntTSL 33.44□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 E2F4-213ENST00000569573 849 ntTSL 323.75■■□□□ 1.398e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 E2F4-212ENST00000568839 944 ntTSL 310.58□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 DPH1-210ENST00000572684 2607 ntTSL 217.68■□□□□ 0.422e-11■■■■■ 41.5
EFTUD2Q15029 DPH1-209ENST00000572248 535 ntTSL 216.12■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 41.5
EFTUD2Q15029 QARS-252ENST00000637908 637 ntTSL 515.37■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 41.5
EFTUD2Q15029 DPH1-217ENST00000607788 775 ntTSL 514.89□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 41.5
EFTUD2Q15029 QARS-211ENST00000470113 954 ntTSL 512.2□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 41.5
EFTUD2Q15029 QARS-216ENST00000482248 887 ntTSL 511.2□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 41.5
EFTUD2Q15029 AIFM3-209ENST00000465606 1592 ntTSL 519.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 ISL2-203ENST00000558656 1446 ntTSL 515.87■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 PLOD1-202ENST00000358133 819 ntTSL 313.04□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 TKFC-217ENST00000533393 597 ntTSL 522.29■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 TKFC-214ENST00000530456 589 ntTSL 220.03■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 IST1-216ENST00000539186 542 ntTSL 49.18□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 PCNX3-203ENST00000530174 1229 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 41.4
EFTUD2Q15029 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 220.56■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 318.58■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 PSMA5-203ENST00000484563 1503 ntTSL 215.48■□□□□ 0.075e-12■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.651e-323■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 SLC2A4-203ENST00000570783 1813 ntTSL 316.3■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 SLC2A4-205ENST00000572485 2995 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 41.3
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