Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 DMTF1-224ENST00000547146 3657 ntTSL 55.44□□□□□ -1.549e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF280D-202ENST00000558002 2274 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.569e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NCKAP1L-207ENST00000549451 629 ntTSL 45.24□□□□□ -1.579e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.659e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 24.73□□□□□ -1.659e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.689e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 QRICH1-208ENST00000469910 204 ntTSL 54.35□□□□□ -1.719e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.779e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.799e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.799e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.819e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF280D-211ENST00000560002 4040 ntTSL 53.62□□□□□ -1.839e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.859e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.869e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DOCK11-204ENST00000633080 6041 ntTSL 53.21□□□□□ -1.99e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 METTL13-205ENST00000476386 283 ntTSL 33.02□□□□□ -1.939e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 210.89□□□□□ -0.678e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.068e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.18e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 COG2-203ENST00000468893 2784 ntTSL 214.16□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 COG2-201ENST00000366668 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 COG2-208ENST00000494371 7836 ntTSL 26.21□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.453e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.273e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.23e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DHX38-205ENST00000564307 785 ntTSL 421.49■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DHX38-203ENST00000563650 1123 ntTSL 315.09■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.77e-8■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.577e-8■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.597e-8■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 331.48■■■□□ 2.637e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 215.73■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 IPO7-202ENST00000527431 607 ntTSL 426.25■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 IPO7-206ENST00000533233 578 ntTSL 417.66■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 EP400-201ENST00000330386 3908 ntTSL 212.96□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 EP400-207ENST00000611739 4314 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DDX1-203ENST00000434671 500 ntTSL 421.4■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 HECTD1-215ENST00000556474 1046 ntTSL 323.23■■□□□ 1.311e-10■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 HERC2-212ENST00000569772 598 ntTSL 514.42□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 216.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 515.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-6■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.247e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 20.5
FMR1Q06787 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-28■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 315.46■□□□□ 0.073e-28■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ATIC-214ENST00000488712 744 ntTSL 314.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 526.8■■□□□ 1.888e-8■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 214.03□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.732e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ZBTB10-201ENST00000379091 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.523e-7■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.724e-8■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.254e-8■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.53e-7■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-215ENST00000515516 661 ntTSL 517.33■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TCOF1-204ENST00000427724 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.57□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.799e-10■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.949e-10■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.219e-12■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 36.01□□□□□ -1.459e-12■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.381e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.241e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.961e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.921e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 223.42■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-214ENST00000511161 579 ntTSL 423.34■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-219ENST00000513956 562 ntTSL 223.34■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-211ENST00000508143 574 ntTSL 423.34■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-209ENST00000505884 592 ntTSL 423.34■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-212ENST00000510058 926 ntTSL 223.27■■□□□ 1.321e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 11e-6■■■■□ 20.4
FMR1Q06787 CCND3-216ENST00000511686 576 ntTSL 319.08■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 20.4
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 85 ms