Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms