Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms