Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APH1BQ8WW43 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APH1BQ8WW43 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms