Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
APH1BQ8WW43 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APH1BQ8WW43 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APH1BQ8WW43 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
APH1BQ8WW43 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APH1BQ8WW43 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
APH1BQ8WW43 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APH1BQ8WW43 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APH1BQ8WW43 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APH1BQ8WW43 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
APH1BQ8WW43 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APH1BQ8WW43 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APH1BQ8WW43 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APH1BQ8WW43 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APH1BQ8WW43 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APH1BQ8WW43 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APH1BQ8WW43 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APH1BQ8WW43 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APH1BQ8WW43 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APH1BQ8WW43 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APH1BQ8WW43 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APH1BQ8WW43 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APH1BQ8WW43 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APH1BQ8WW43 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APH1BQ8WW43 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APH1BQ8WW43 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APH1BQ8WW43 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APH1BQ8WW43 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APH1BQ8WW43 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APH1BQ8WW43 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APH1BQ8WW43 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APH1BQ8WW43 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APH1BQ8WW43 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APH1BQ8WW43 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APH1BQ8WW43 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APH1BQ8WW43 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APH1BQ8WW43 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APH1BQ8WW43 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APH1BQ8WW43 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APH1BQ8WW43 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APH1BQ8WW43 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APH1BQ8WW43 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APH1BQ8WW43 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APH1BQ8WW43 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APH1BQ8WW43 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APH1BQ8WW43 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APH1BQ8WW43 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APH1BQ8WW43 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APH1BQ8WW43 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APH1BQ8WW43 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APH1BQ8WW43 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APH1BQ8WW43 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APH1BQ8WW43 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APH1BQ8WW43 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APH1BQ8WW43 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APH1BQ8WW43 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APH1BQ8WW43 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APH1BQ8WW43 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APH1BQ8WW43 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APH1BQ8WW43 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APH1BQ8WW43 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APH1BQ8WW43 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APH1BQ8WW43 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APH1BQ8WW43 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APH1BQ8WW43 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APH1BQ8WW43 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APH1BQ8WW43 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APH1BQ8WW43 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APH1BQ8WW43 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APH1BQ8WW43 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APH1BQ8WW43 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APH1BQ8WW43 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APH1BQ8WW43 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APH1BQ8WW43 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APH1BQ8WW43 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APH1BQ8WW43 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APH1BQ8WW43 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APH1BQ8WW43 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APH1BQ8WW43 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APH1BQ8WW43 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APH1BQ8WW43 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APH1BQ8WW43 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APH1BQ8WW43 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APH1BQ8WW43 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APH1BQ8WW43 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APH1BQ8WW43 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APH1BQ8WW43 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APH1BQ8WW43 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APH1BQ8WW43 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APH1BQ8WW43 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APH1BQ8WW43 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APH1BQ8WW43 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APH1BQ8WW43 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms