Protein–RNA interactions for Protein: Q86YB7

ECHDC2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC2Q86YB7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECHDC2Q86YB7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms