Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ODF1Q14990 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ODF1Q14990 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ODF1Q14990 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ODF1Q14990 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ODF1Q14990 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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