Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 DHODH-203ENST00000571392 2165 ntTSL 515.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 HDAC10-216ENST00000489424 759 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-10■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-10■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 PIGQ-205ENST00000420990 932 ntTSL 514.54□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 PIGQ-224ENST00000638143 563 ntTSL 514.17□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 HDAC10-213ENST00000482213 469 ntTSL 313.22□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 WNK2-210ENST00000462595 295 ntTSL 311.09□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 WNK2-215ENST00000478583 537 ntTSL 410.85□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHODH-206ENST00000573843 549 ntTSL 410.07□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHODH-208ENST00000574309 607 ntTSL 59.92□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 JAG1-204ENST00000612857 586 ntTSL 59.4□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHODH-204ENST00000572003 542 ntTSL 48.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHODH-207ENST00000573922 427 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 JAG1-205ENST00000613518 597 ntTSL 57.83□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 TBCD-216ENST00000574886 883 ntTSL 512.08□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 TBCD-215ENST00000574818 771 ntTSL 39.19□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 31.5
SF3A3Q12874 ATP6V0A1-216ENST00000587882 780 ntTSL 23.82□□□□□ -1.82e-8■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-206ENST00000470600 574 ntTSL 27.95□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 31.4
SF3A3Q12874 CYP4F12-205ENST00000518629 1915 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 CYP4F12-216ENST00000550627 2264 ntTSL 215.05■□□□□ 02e-9■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 CYP4F12-204ENST00000517734 2860 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 CYP4F12-206ENST00000546608 3256 ntTSL 29.85□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.777e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.057e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.27e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 RAB5C-204ENST00000547517 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 310.42□□□□□ -0.747e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 DUS1L-206ENST00000577907 648 ntTSL 323.49■■□□□ 1.352e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 520.19■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 MVD-205ENST00000562981 537 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 PFDN6-207ENST00000491382 989 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 SFSWAP-209ENST00000540469 3536 ntTSL 314.24□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 514.01□□□□□ -0.172e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 APOC3-204ENST00000470144 269 ntTSL 511.06□□□□□ -0.642e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.772e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 28.94□□□□□ -0.982e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 APOC3-203ENST00000433777 359 ntTSL 58.89□□□□□ -0.992e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 RBM39-235ENST00000490354 436 ntTSL 24.32□□□□□ -1.722e-12■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 HEMK1-205ENST00000448997 5757 ntTSL 213.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 LAMA5-210ENST00000491036 728 ntTSL 213.85□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.039e-10■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-10■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.239e-10■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.079e-10■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.319e-10■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.64□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 HNRNPA1-212ENST00000551679 359 ntTSL 25.02□□□□□ -1.619e-10■■■■■ 31.3
SF3A3Q12874 TMEM18-207ENST00000477202 1767 ntTSL 221.13■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TMEM18-206ENST00000461640 844 ntTSL 319.43■□□□□ 0.74e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TMEM18-205ENST00000432667 2572 ntTSL 514.48□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TMEM18-204ENST00000418447 623 ntTSL 314.39□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 PTDSS2-209ENST00000530029 579 ntTSL 213.82□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 AMPD2-226ENST00000534144 544 ntTSL 412.91□□□□□ -0.344e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TMEM18-202ENST00000355654 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 522.41■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 WDR90-214ENST00000549024 2257 ntTSL 219.32■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 WDR90-225ENST00000553080 1941 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TUBGCP2-206ENST00000477923 512 ntTSL 215.34■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 TTYH3-206ENST00000477439 731 ntTSL 214.37□□□□□ -0.115e-15■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 511.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 416.15■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 31.2
SF3A3Q12874 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.85e-13■■■■■ 31.1
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