Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPFP49454 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPFP49454 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms