Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJB4Q9UDY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms