Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PGPEP1Q9NXJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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