Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms