Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms