Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIFAQ96CG3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms