Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf54Q8N8G6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf54Q8N8G6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms