Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms