Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms