Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms